前言
作为科研“达人”,“蛋白与蛋白的相互作用”这一课题想必大家都很熟悉。研究这一课题的套路很多,这里我们重点聊一聊磁珠在这方面的应用。
磁珠的结构
磁珠是一类具有超顺磁性的磁纳米粒子。所谓超顺磁性,是指磁珠在外磁场的作用下具有弱磁性,容易被吸附,撤去磁场后没有剩磁,容易被分散。
磁珠的结构一般包含磁性的内核(通常为铁的衍生物)、具有良好生物相容性的外壳 以及 外壳上偶联的各种配体(如羧基、氨基等官能团或Protein A/G、抗体等生物大分子)。下图为羧基磁珠示意图。
羧基磁珠示意图
磁珠之所以能在蛋白互作上大显身手,突出的特点就是蛋白荷载量高,特异性强,样品损失小,操作便捷。总之就是简单加方便!
一般的实验流程如下:
1. 磁珠与样品共同孵育,捕获目的蛋白;
2. 加外磁场吸附磁珠,弃掉上清液;
3. 加入漂洗液漂洗,去掉非特异结合蛋白;
4. 加入洗脱液洗脱,收集目的蛋白。
如何选择磁珠?
蛋白纯化磁珠常用的配体有Protein A、Protein G、Protein A/G、标签蛋白抗体、链霉亲和素蛋白等。
Protein A/G磁珠是在磁珠表面偶联Protein A/G,而Protein A/G能与IgG相结合,因此可以用来纯化各种抗体。Protein A/G磁珠也可以通过结合不同的抗体,形成“磁珠-抗体-抗原”复合物,从而捕获相应的抗原或互作蛋白。
Protein A/G磁珠工作原理图
相同工作原理的磁珠还有Protein A磁珠和Protein G磁珠。Protein A和Protein G以及Protein A/G在与不同抗体亚型的结合能力上有所差别,选择时可以参照下表。Protein A/G由于是Protein A和Protein G抗体识别区域的重组融合蛋白,因此通常在实验中表现更佳。
YJ001 | Protein A磁珠 |
YJ002 | Protein G磁珠 |
YJ003 | Protein A/G磁珠 |
需要注意的是,Protein A能与抗体Fc端特异性结合,Protein G不仅能与Fc端结合,还能低亲力与Fab端特异性结合。
所以需要纯化抗体Fab端的小伙伴,可以选择Protein A磁珠特异性去除Fc端,这样就可以获得Fab端啦!
另外,我司还提供一种琼脂糖磁珠,与普通磁珠相比,琼脂糖磁珠的IgG蛋白荷载量更高,更适合用来纯化大量的IgG。
YJ101 | Protein A琼脂糖磁珠 |
YJ102 | Protein G琼脂糖磁珠 |
YJ103 | Protein A/G琼脂糖磁珠 |
根据抗原抗体结合的特异性,研究者将抗体直接与磁珠偶联,获得抗体偶联磁珠,如anti-Flag免疫磁珠、anti-Myc免疫磁珠等,可以用来直接捕获对应的抗原。
与ProteinA/G磁珠相比,抗体偶联磁珠不用考虑抗体种属以及亚型的选择,操作上也少了磁珠和抗体结合的步骤,大大缩短实验时间。目前大部分磁珠偶联的抗体为通用的标签蛋白抗体,包括Flag、HA、Myc、GST、His等,因此更适合用来捕获外源表达的标签融合蛋白。
抗体偶联磁珠工作原理图
YJ005 | Anti-HA免疫磁珠 |
YJ006 | Anti-Myc免疫磁珠 |
YJ007 | Anti-Flag免疫磁珠 |
YJ008 | Anti-GST免疫磁珠 |
YJ009 | Anti-His免疫磁珠 |
YJ010 | Anti-GFP免疫磁珠 |
还有一种常用的磁珠——链霉亲和素磁珠,是将链霉亲和素蛋白(SA)偶联在磁珠上,依靠链霉亲和素和生物素(Biotin)的特异性结合,能捕获被生物素标记的生物大分子,如生物素化蛋白、核酸等。其结合能力比抗原抗体的特异性结合更强。
链霉亲和素磁珠工作原理图
YJ011 | 链霉亲和素磁珠 |
常见问题分析
01
用Protein A/G磁珠做免疫沉淀试验(IP)时,没有捕获到目的蛋白?
a、检测体系中目的蛋白是否有表达;
b、细胞裂解液需新鲜制备,加入合适的蛋白酶抑制剂;
c、IP抗体的质量问题。
02
用标签抗体偶联磁珠做IP,标签应该构建在蛋白的N端还是C端?
理论上标签不管连在蛋白的N端还是C端都可以,前提是标签蛋白没有被融合蛋白的三维结构包裹起来,以及不影响目的蛋白的生物学功能。
03
在IP过程中出现非特异性条带如何处理?
a、减少磁珠与样品孵育时间;
b、增加漂洗次数;
c、减少样品总蛋白浓度;
d、如果使用的是Protein A/G磁珠,可以先将样品与Protein A/G磁珠(不加抗体)孵育30min进行预清除,去除样品中能和磁珠非特异性结合的杂蛋白。
04
进行Protein A/G磁珠和抗体偶联磁珠的回收时,需要注意哪些问题?
a、非变性洗脱后的磁珠才能进行回收,如低pH洗脱;
b、回收的磁珠只适合用来重复纯化同种抗体或者标签蛋白;
c、回收的磁珠不建议用来做Co-IP,以免磁珠上残留的蛋白干扰实验结果。
05
Protein A/G磁珠和抗体偶联磁珠回收步骤有哪些?
a、非变性洗脱后的磁珠用低pH洗脱液洗脱3-5次;
b、再用PBS洗3-5次;
c、保存在PBS溶液中,短期内可以重复使用。
06
保存磁珠需要注意哪些问题?
磁珠严禁冻结,这会降低磁珠的蛋白结合能力。磁珠置于常温,性能影响不大,但需及时放回4℃。
磁珠及相关产品目录
货号 | 名称 | 规格 | 价格 |
YJ001 | Protein A磁珠 | 1mL | 748元 |
YJ002 | Protein G磁珠 | 1mL | 748元 |
YJ003 | Protein A/G磁珠 | 1mL | 748元 |
YJ004 | Protein L磁珠 | 1mL | 1128元 |
YJ005 | Anti-HA免疫磁珠 | 1mL | 1838元 |
YJ006 | Anti-Myc免疫磁珠 | 1mL | 1838元 |
YJ007 | Anti-Flag免疫磁珠 | 1mL | 1838元 |
YJ008 | Anti-GST免疫磁珠 | 1mL | 1838元 |
YJ009 | Anti-His免疫磁珠 | 1mL | 1838元 |
YJ010 | Anti-GFP免疫磁珠 | 1mL | 1838元 |
YJ011 | 链霉亲和素磁珠 | 1mL | 1128元 |
YJ012 | 伴刀豆球蛋白 A(ConA)磁珠 | 1mL | 748元 |
YJ101 | Protein A琼脂糖磁珠 | 1mL×2 | 1138元 |
YJ102 | Protein G琼脂糖磁珠 | 1mL×2 | 1138元 |
YJ103 | Protein A/G琼脂糖磁珠 | 1mL×2 | 1138元 |
YJ104 | His标签蛋白纯化琼脂糖凝胶 | 1mL×10 | 568元 |
YJ105 | GST标签蛋白纯化琼脂糖凝胶 | 1mL×10 | 848元 |
YJ106 | His标签蛋白纯化琼脂糖磁珠 | 1mL×5 | 918元 |
YJ107 | GST标签蛋白纯化琼脂糖磁珠 | 1mL×5 | 918元 |
YJ108 | Anti-Flag免疫凝胶 | 1mL | 1838元 |
YJ201 | 经典Protein A/G免疫(共)沉淀试剂盒 | ≥40次 | 1198元 |
YJ202 | 基础免疫(共)沉淀试剂盒(无磁珠) | ≥40次 | 598元 |
YJ203 | 经典Protein A免疫(共)沉淀试剂盒 | ≥40次 | 1198元 |
YJ204 | 经典Protein G免疫(共)沉淀试剂盒 | ≥40次 | 1198元 |
YJ205 | HA免疫(共)沉淀试剂盒 | ≥40次 | 2198元 |
YJ206 | Myc免疫(共)沉淀试剂盒 | ≥40次 | 2198元 |
YJ207 | Flag免疫(共)沉淀试剂盒 | ≥40次 | 2198元 |
YJ208 | Flag免疫(共)沉淀试剂盒(凝胶) | ≥40次 | 2198元 |
YJ209 | GST免疫(共)沉淀试剂盒 | ≥40次 | 2198元 |
YJ210 | His免疫(共)沉淀试剂盒 | ≥40次 | 2198元 |
YJ211 | GFP免疫(共)沉淀试剂盒 | ≥40次 | 2198元 |
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