亲和层析具有高选择性、高分辨率、高结合载量的优点，经常可以一步纯化达到＞90%的纯度，能够完成一般方法很难完成的分离。

●首先，选择合适的缓冲液平衡层析柱，以保证目标分子与配体的结合效率在最佳范围内。

●上样时，目标分子多数结合在配体上，由于混合样品中的杂质不能与配基有效的结合而流穿下来。

●上样完成后，层析柱上通常含有非特异性吸附的杂质分子，需要先将这些杂质洗脱。

●杂质取出后，再利用洗脱液将目标分子从配体上洗脱下来。

●亲和层析的洗脱类型分为非竞争性洗脱（改变缓冲液的组成，如离子强度，改变pH等）和竞争性洗脱（目标分子类似物和配体类似物等）。

●亲和层析具有高选择性、高分辨率、高结合载量的优点，经常可以一步纯化达到＞90%的纯度，能够完成一般方法很难完成的分离。

配基+基架类型+基球特性

配基的不同，对应应用场景也不相同。

镍-：分离带His标签的重组蛋白及能被金属离子吸附的多肽、蛋白、核苷酸、磷酸化蛋白。

镍NTA琼脂糖凝胶FF：具特异性好流速快，螯合镍更稳定，能耐受更高的还原剂，物理和化学稳定性好，批次重复性好。已经螯合好镍离子，使用更方便，由于颗粒粒度均匀，粒径小，所以分离效果更好，可完全代替进口产品。 

蓝色&红色：亲和层析介质，纯化干扰素、α2-巨球蛋白、凝血因子、需要核苷酸辅助的酶

肝素：肝素能和抗凝血因子Ⅲ、凝血因子、蛋白合成因子、脂蛋白、干扰素、核酸结合蛋白、限制内切酶、凝血酶及类凝血酶等生物大分子结合，所以肝素琼脂糖凝胶可以用于这类物质的纯化。

谷胱甘肽：亲和层析介质，纯化羧端含谷胱甘肽 S-转移酶重组融合蛋白或依赖 S-转移酶或谷胱甘肽的蛋白。

胰蛋白酶：亲和层析介质，纯化胰蛋白酶抑制剂、抑肽酶。

苯甲脒：纯化胰蛋白酶、凝血酶、尿激酶、激肽释放酶、前激肽释放酶等丝氨酸蛋白酶。

ConA：纯化糖蛋白、膜蛋白、糖脂、多糖、带甘露糖苷或葡萄糖苷残基的膜囊泡，激素，脂蛋白等。

赖氨酸：纯化血纤维蛋白溶酶原等。

羧基：纯化含有氨基配体的物质等。

明胶：纯化或去除血纤维结合蛋白等。

精氨酸：前激肽释放酶，纤溶酶原激活物，凝血酶原和成熟促进因子等。